高青县由原高苑、青城两县于1948年合并而成。唐坊店子遗址表明，大约6500年前的新石器时代，人类已开始在这里发展自己的文明史，属大汶口文化和龙山文化。位于高城镇堤西李村东的被国遗址，是山东地区东夷民族最早的方国之一。位于高城镇陈尧村的狄城遗址，发现商代陶器。被列入2009年全国十大考古新发现的陈庄西周遗址出土的青铜器铭文表明，此地与姜太公封齐初建都城密切相关。    

春秋初，今高城北为鄋瞒国地。公元前685～643年，齐桓公将高城及邹平的苑城一带辟为苑囿，更名高苑（故址在今邹平的苑城店）。高城及南部为高苑地，高城北为狄城地。公元前607年，高青复为齐地。

战国时期，高青地属齐。

秦时，置狄县（今高城一带）。高青东部隶临淄郡，青城西部、黑里寨大部属济北郡。 

西汉置千乘郡，故城在今高城北25公里。又置千乘县（今唐坊镇孙集村东南1.5公里有遗址）。《齐记》：千乘城在齐城西北百五十里，有南北二城，相距10余公里，其一城县治，一城太守治。此二城即千乘县与千乘郡。又置东邹县（今花沟镇一带）。汉高帝六年（公元前201年），刘邦封丙倩为高宛侯，后为高宛县。西汉元朔四年（公元前125年），汉武帝封齐孝王子燕为被阳侯。时高青东部属高宛侯国、被阳侯国地。后为狄县、被阳县、高宛县地，均属千乘郡。狄城在今高城西北，被阳城（今高城址）在狄城东南，两城隔水（济水）相望。高青西部主要为东邹县、建信县地，皆隶千乘郡。最西部为邹平县地，属济南郡。 

王莽新政时，狄城更名利居。

东汉初，复置狄县，改高宛县为高苑县。《水经注》载：高苑有东西二城，西城即丙倩侯国（今邹平县苑城）。汉永平三年（60年），千乘郡改名千乘国；翌年，复为千乘郡。汉建初四年（79年），汉章帝封其子刘伉为千乘国王，千乘郡复称千乘国。汉永元七年（95年），千乘国改名乐安国。公元108年，狄县更名临济县，乐安国移治临济。汉质帝时乐安国改为乐安郡，千乘县、临济县、高苑县等属乐安郡。时被阳县、建信县、东邹县已废，高青大部属临济县、千乘县、高苑县。青城西部为梁邹县地，属济南国。 

三国魏时，高青为临济县、千乘县、高苑县地，属乐安郡。乐安郡治高苑（今邹平苑城）。青城以西为邹平县地，属济南国。乐安郡和济南国皆隶青州。

西晋时省千乘县。高青东部为临济县、高苑县地，属乐安郡。西部的青城及花沟、黑里寨沿小清河部分属邹平县，隶济南郡。

十六国时先后属后赵、前燕、前秦、后燕、南燕国地，仍为临济、高苑、邹平县地，分隶乐安郡和济南郡。

南北朝时，南朝宋省高苑县，将临济县迁于县西部刘家镇（今黑里寨刘镇）。复置千乘郡并移治今广饶县境。临济城更名长乐，侨置长乐县（今河北省冀县、衡水、枣强等县为古长乐地，时长乐人南迁至此，沿用长乐之称，置县）。在今高青、博兴之间，侨置阳信县。此时，高青县境为侨长乐县、侨阳信县和临济县地。临济县属平原郡，侨阳信县属侨乐陵郡，孝武帝刘骏在古被阳城侨置渤海郡，属侨冀州，皆隶属青、冀二州。乐安郡已移置广饶境内千乘城。北朝魏设长乐郡，郡治在长乐城，高青地为长乐、临济县地，长乐县属长乐郡，隶青州；临济县属东平原郡，隶齐州。北朝东魏，高青地属青州。北朝齐废长乐郡，移长乐县治于被阳故城，改属齐郡，隶青州。 

隋朝统一后，高青初为长乐县、邹平县地，属齐郡，隶青州。隋开皇十八年（598年），长乐县更名会城县，县治在今博兴南古苑庄。隋大业三年（607年），改会城县为高苑县，县治移于长乐城，即今高城。仍属齐郡，隶青州。后为高苑、邹平县地。

唐朝，高青为高苑、邹平县地。唐景龙元年（707年），析高苑一部置济阳县，县治在今邹平县旧口；唐元和十五年（802年），并入高苑县。唐朝，在今青城镇地置青平镇，属邹平县。

五代时，为高苑、邹平县地，属淄州。 

宋朝，为高苑、邹平县地，属淄州，隶京东东路。宋景德三年（1006年），在高苑置宣化军，领高苑县。宋熙宁三年（1070年），以县令兼军使。

金朝，废宣化军，高青仍为高苑、邹平县地，属淄州，隶属山东东路。据《山东通志》载：金天兴二年（1233年），始置青城县，不久即废；元太宗七年（1235年）复置青城县。民国24年《青城县志》载：金天兴二年（1233年）始置青城县，属济南路，后废；元太宗七年（1235年）析临邑、宁津地复置，隶济南府。 

元朝，高苑县小清河以南所属村庄大部分划为新城县（今桓台）、邹平县。高苑初属淄州，公元1265年州废，改属益都路总管府，隶山东东西道宣慰司。青城县初隶济南路，中统时属陵州，至元年间改隶河间路。至元二十四年（1287年），置般阳路，高苑县西、青城县东、小清河北、大清河南包括田镇在内的区域为般阳路的新城、蒲台县地。

明洪武二年（1369），青城县并入邹平、齐东县，青城更名为清池店。明洪武十四年（1381年），复置青城县，属济南府；高苑县改属青州府。两县皆属山东布政使司。 

清雍正十二年（1734年），高青为三府四县地，东南部为高苑县地，属青州府；西南部为邹平县地，属济南府；西北部为青城县地，东北部为蒲台县地，皆属武定府。

民国元年（1912年），废府改道，高青为高苑县、青城县、蒲台县、滨县、齐东县、邹平县地，隶属岱北道。民国3年（1914年）改属济南道。民国14年（1925年），山东省分设十道，青城县、蒲台县、滨县划属武定道。民国17年（1928年）废除道制，各县直属省辖。民国25年至民国31年（1936年至1942年），高苑县、青城县属国民党第十行政督察专员公署，隶鲁北行署。民国34年（1945年），高苑县、青城县仍属国民党第十行政督察专员公署，隶鲁北政府办事处。 

中国共产党领导的民主政权在抗日战争中逐步形成。1940年，高苑县、青城县属清河专署。1943年，高苑县、青城县隶属清河行政公署。1945年，高苑县、青城县属清河专员公署，隶属渤海行政公署。

1948年4月，高苑县、青城县合并为高青县，县城为田镇。高青县初属第三专员公署，后属清河专员公署，隶渤海行署。1950年县城迁址青城，同年5月，高青县隶属惠民专署。1952年，县城复迁田镇。1956年3月，高青县与齐东县合并，改称齐东县，政府驻田镇，隶惠民专署。1958年11月，将齐东县析入博兴、邹平县，皆属淄博专署。1961年10月，复置高青县，政府仍驻田镇，隶惠民专署。1990年1月1日，高青县划归淄博市，东北部的旧镇镇划归滨州市。

高青地历史上境域及行政区划多次调整。 

清末，高苑县境域，北边线东起杨桥，经崔家、宫家、后赵、前赵、申庄、司马庄、许家、彭家、洼里杨、刘三仁、王庄、刘庄大官庄、杜家、尹庄、傅庄、台陈、周庄到王凤庄，与蒲台、滨县、青城县接壤；南边线东起堰头，经小清河南的东闸、崔庄、大园、小园、朱家庄、马家围、东辛庄、王明桥、柳村、吴家园、高苑桥、姚王庄、摊子、孙家桥、王家庄、祁家、马庄、小张庄、码头村、岔河，过小清河西至程尔头，与桓台县为邻；东边线南起东闸，经堰头、苗家集、邵洼庄、李凤鸣、得胜官庄至杨桥，与博兴县接壤；西边线北起王凤庄，经官庄、赵庄、郭庄、尹庄、马庄、韩连庄、前后池、庄头至程尔头，与邹平县搭界。区划沿用乾隆二十二年（1757年）划分的东西南北40约，后改为东西南北4路，领40约。 东路领10约，46个村庄；西路领10约，57个村庄；南路领10约，49个村庄；北路领10约，70 个村庄。

青城县境域，北边线西起马扎子，东至翟徐村，大部分以黄河与惠民县为界；东段边界越过黄河，经粉李家、孙家、宫家、双庙杨家、大杨家集、王家寺至董家口。南边线西起王矮子，经魏家、小王庄、史家、八沟里、庄家、赵家、傅家、沟王、天师家、香王、窦家、胡李庄、沙高家、马家、徐家、侯家、宁家、阮家、于家，东至周家，与齐东、邹平、高苑县邻界；东边线北起黄河北的董家口，过黄河至翟徐、杨王庄、水牛李、吕八庄，南至周家，与高苑县毗邻；西边线北起马扎子，经皮家、小孙庄、王家庄、界牌张、界牌杨、粉张、沙里、崔家、潘家，南至王矮子，与齐东县为邻。区划在乾隆十一年（1746年）曾划为9乡，分别为在坊乡、仁义乡、嘉会乡、长山乡、亲仁乡、青城乡、正德乡、义和乡和城内坊，共辖320个自然村。宣统二年（1910年），改为10个区，以至、德、乾、坤、大、洪、恩、雨、露、深10个字为各区标志。

民国时期，高苑县境域同清末，区划有变动。1931年，设4个区，即一区（丁夏）、二区（河西）、三区（寨子）、四区（唐坊），下设1镇88个乡，后改为62个乡（镇），辖214个自然村。1939年，日军侵占后，仍按4个区统治。仅将62个乡（镇）并为40个乡（镇）。抗日战争初期，高苑县抗日民主政府仍按4个区管理（不含小清河南部分）。为便于领导人民开展斗争，1940年将滨五区、1942年1月将小清河南岔河到东闸20个村、1943年6月将邹七区和蒲一区划归高苑县。1945年，高苑县有6个区，即丁夏、河西、寨子、唐坊、旧镇、大李区。 

青城县境域仍按清末宣统二年（1910年）区划管辖。1930年冬，并为4个区，辖5镇79个乡，312个村庄。1944年6月，中共青城县工作委员会按原4个区管理。1945年冬，中共渤海区三地委将邹七区划归青城县，称第五区。

1948年4月23日，高苑县、青城县合并，成立高青县民主政府，设11个区，即城关、寨子（健萍）、河西、丁夏、唐坊、旧镇、大李、义和、九如、码头、花沟（子恒）区。辖728个村。不久，码头区撤并。1949年10月，将黄河以北13个村庄划归惠民县。1951年，全县划为10区，辖72个乡。后将于毛乡划归齐东县，为71个乡。境域东边线北起小街，经博古孙、贺家、窑洼、郑家埝、李凤鸣至仉家与博兴县接壤；南边线东起堰头，经姚家套、堤西李至前营，与桓台县隔小清河为邻；西南部边线东起唐口，经曹家坡、前陈、聂家寺、李家、小牛家至北董，与邹平县隔小清河为邻；西部边线南起马扎子，经连五庄、码头、彭家庙、内赵、北李，隔黄河与惠民县为界；北部边线西起清河镇，经内董、内杨、小开河、五合庄、刘春、贾家、大道王、姜家街至小街，与惠民、滨县隔黄河相望。1951年，高青境域东西最大横距45公里，南北最大纵距26公里。 

1956年3月，高青、齐东合并为齐东县。全县总面积1644.75平方公里。北、西两面与滨县、惠民、济阳县以黄河为界。南边线西段西起苗家，经田家、刘王、还乡、小赵、小郭、五龙堂、苏家、魏家、夏家、南郑、张重良、陈玉平、范家与章丘、邹平县接壤；东段西起胥家，东至堰头，经杨庄、得胜、崔家、傅家、周家、博古孙、东常家、西常家，北至台西刘与博兴县为邻。6月，全县划为1镇11区，即田镇镇、寨子区、旧镇区、义和区、青城区、花沟区、丁夏区、河西区、黑里寨区、九湖区、曹家码头区、台子区；辖106乡、1113个村庄。11月，将小清河南的高苑桥、大园、祁家乡20个村庄划归桓台县；至1956年底，全县设8个区，辖41乡，1093个村庄。

1957年底撤区，全县调为40个乡，即田镇、唐坊、徐霞、花沟、榆林、青城、于孟、高城、义和、大李、旧镇、木李、台李、田楼、赵店、窑洼、东刘、丁夏、孙家集、李官、杨家庄、河西、寨子、黑里寨、归苏、刚斧寨、和家店、九户、台子、曹务、大坡、路家、张官庄、吴庄、中店、曹家码头、魏桥、店子、十六户、石店乡。

1958年2月，撤刚斧寨、十六户、台李、窑洼、榆林、李官、店子、河西、徐霞、路家10个乡。3月，撤木李、孙家集、吴庄3个乡。7月，撤张官店乡。9月，撤乡，全县建立田镇、高城、唐坊、旧镇、花沟、青城、黑里寨、九户、码头、魏桥10处人民公社。11月3日，齐东县析入博兴县和邹平县。

1961年10月4日，复置高青县，全县划为7个区，即田镇区、青城区、黑里寨区、花沟区、唐坊区、高城区、旧镇区。辖53个人民公社、834个自然村、849个生产大队。1963年2月，将青城区郑庙、义和公社划归田镇区，田镇区元河公社划归唐坊区。1970年11月，将7个区改称公社，原53个人民公社改称管理区。1971年，撤销贺家、太平、王楼、夏楼管理区。1972年，撤销台陈、唐口管理区。1974年，恢复唐口管理区。

1981年，田镇公社改称田镇镇。1982年，全县设1镇、6个公社、48个管理区，辖807个生产大队、825个自然村。

1983年6月，根据地名普查情况，县政府批准注销黄河堤内实地无存的29个自然村名称。    

1984年6月，撤公社、管理区，高青县划为4镇15乡，即田镇镇、旧镇镇、高城镇、青城镇、寨子乡、许管乡、唐坊乡、元河乡、田家楼乡、赵店乡、花沟乡、樊家林乡、龙桑树乡、杨家坊乡、木李乡、黑里寨乡、孟集乡、常家乡、丁家乡。1985年3月，黑里寨乡改称镇。同年，高青县南边线为小清河；北边线为黄河；东部县界自南向北是堰头、杨庄、李凤鸣、孟君寺、德胜、崔家、傅家、新庄、贺家、邱家、周家、大李家、大刘家、小刘家、博古孙、坡刘、东常家、小街、董家集、姜家街；西部县界，自南向北是前崔、李家、辛庄、袁家、经家、季家、官庄、潘家、贺家。全县辖5镇14乡，816个自然村，837个村民委员会。全县总面积为896.5平方公里。 

1987年2月13日，调整乡镇区划，撤销寨子乡，并入田镇镇；撤销丁庄乡，并入高城镇；撤销孟集乡，并入黑里寨镇；撤销元河乡，并入唐坊乡；撤销许管乡，并入常家乡；撤销杨坊乡，将杨坊管区并入木李乡，将码头管区并入青城镇；撤销田楼乡，将西马管区划归赵店乡，将田楼管区划归旧镇镇；撤销龙桑树乡，将龙桑管区并入花沟乡，将杨庄管区并入樊家林乡。是年，全县辖5镇6乡、816个自然村、837个村民委员会。

1990年1月1日，高青县划归淄博市，所辖旧镇镇析入惠民地区，全县设4镇6乡。1994年12月29日，唐坊乡撤乡设镇；1995年9月，常家乡撤乡设镇；1996年12月25日，赵店乡、花沟乡撤乡设镇；1998年4月，木李乡撤乡设镇；2000年8月17日，成立高青县城区办事处；2001年3月，樊家林乡并入花沟镇。至2004年底，全县设9个镇、1个城区办事处，即田镇镇、青城镇、高城镇、黑里寨镇、唐坊镇、花沟镇、常家镇、木李镇、赵店镇和县城区办事处。辖767个行政村、740个自然村。人口36.1万人。

2010年，高青县区划调整，田镇镇被分为田镇街道和芦湖街道；撤销赵店镇，整建制并入常家镇。是年，高青县改为省财政直管县，属省政府和淄博市双重管理，县城驻地田镇。

2012年12月，县行政区划调整，原隶属于花沟镇的忠信村、义和村、拥护村、保证村、袁家村、东刘村、明李村、道口村、庄头村和程尔头村10个村庄划入高城镇；将花沟镇的沙高村、韩连村、后池村、前池村、胡家村、杜郭村6个行政村划归田镇街道管辖。2013年3月，高青县区划再次调整，将原隶属赵店镇的47个行政村划归芦湖街道管辖；芦湖街道的尹家村、付家村、孟李村、大庄村等4个行政村划归常家镇管辖。在此基础上，高青经济开发区与常家镇合署。